お久しぶりです。
ご報告ありがとうございます。

バグについてですが…
えーっと、状況をもう少し詳しく知りたいのですが
・フォロウでプレイ時=ソウルプリズン探索モードの状況　で、
・2周目での追加キャラにフォロウの技能（3種類）が全て表示されてしまっている。
てことでいいでしょうか？

上記の現象で合っているとしたら
考えられる原因は「旧Verからの引継ぎによる不具合？」なのかなー？
少なくともファントムではなく魂のキャラ技能を
直接弄って技能を習得するような処理はゲーム中には入っていない筈なのです。
見落としの可能性もあるので、もう少し原因を調べてみる必要がありそうです…。
もし何か他に気づいたこと等あれば教えて頂けると助かります。

はい。
｢・フォロウでプレイ時=ソウルプリズン探索モードの状況　で、
・2周目での追加キャラにフォロウの技能（3種類）が全て表示されてしまっている。｣
であってます。

わかりづらい言い方ですいません。

とりあえず修正することはそんなに難しくないのですが
原因が分からんのですよね…。
もし、この書き込み見ている方で同じ症状が起きた方は
原因究明の絞込みの為に教えて頂けると助かります。

で、肝心の修正についてですが
このバグ用の専用修正パッチをUPしようと思います。
ちと面倒な手順ですが
パッチ当てる⇒ゲーム内部で修正処理を行う⇒パッチ前の状態に戻す
という方法で対処して頂く事になるかと…。

それとは別に通常の修正パッチでも修正させていただきます。
ただ、こちらのパッチだと
周回引継ぎ時に修正処理を行う感じになるので
ゲーム途中で修正をする場合は上記の専用パッチで修正する必要があります。

…と、こんな感じで対処させてもらおうかと考えています。
パッチは明日あるいは土日にUP出来ればと思っています。
以上、宜しくお願いします。

遅ればせながら、ご報告いたします。
こちらの現象は私の方でも起こってました。
2周目スタート時から気づいてたんですが、
こういうものなのかな？と思いこんでました。

おお、ご報告ありがとうございます。

Ver1.04以前からVer2.0以降へデータを移動した際に
起きていると思うんですけど、試していないので確証がもてないんですよね。
とりあえずVer2.09以降は引継ぎ時に今回のバグ修正処理を行うようにしたので
もう大丈夫かとは思いますが。。。